提速近10倍!基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日,中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用,将助力深度学习在全基因组选择中的应用,为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物(Molecular Plant)》上。
全基因组选择作为新一代育种技术,通过构建预测模型,根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择,从而缩短育种世代间隔,加快育种进程,节约成本,推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心,极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型,难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型,非线性模型(如深度网络神经)具备分析复杂非加性效应的能力,人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机,深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料,通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比,该方法有以下优点: 可以利用多组学数据开展全基因组预测;算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构,可以有效降低模型错误率,提高运行速度;预测精度稳健,在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当,在大规模数据集上预测优势更加明显;计算时间与传统方法相近,比已有深度学习方法提速近10倍;超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
C919兔年首飞打卡南昌 100小时验证飞行起降已涉多地******
中新网1月28日电(中新财经 葛成) 中新财经从东航获悉,1月28日大年初七,中国东航全球首架国产C919客机执行MU7817虹桥至南昌航班,“打卡”100小时验证飞行南昌航点,这是国产大飞机首次在南昌昌北国际机场亮相,也是C919的兔年第一飞。
据介绍,1月28日的南昌验证飞行是C919在癸卯兔年的首次飞行,当天执行MU7817/8,MU7819/20两个虹桥南昌往返航班。
C919飞机100小时验证飞行起降涉及北京首都、北京大兴、成都天府、西安、海口、青岛、武汉、南昌等多地多机场。验证飞行需要模拟整个航班的运行过程,包括签派放行、旅客登机、飞行员操作、机务维修等全流程。
国产大飞机首次在南昌昌北国际机场亮相。 东航供图东航介绍,目前,东航已完成首批9名飞行员、24名乘务员、13名机务维修人员的C919机型培训,加上正在培训的第二批次重点岗位人员,C919飞机的保障人员数量足以满足初期的验证飞行需求。
在C919完成航线验证飞行后,中国民航局将对验证结果进行审定和检查,确认东航具备安全运行C919飞机的能力,颁发相应的运营许可。中国东航争取在2023年春正式开启C919商业载客运营。届时,C919将出现在上海、北京、西安、昆明、广州、成都、深圳等地的精品航线上。(中新财经)
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